NSA oddalił skargę kasacyjną organu w sprawie zakresu zwolnienia w PSI dla decyzji o wsparciu sprzed 2022 r.
Na rozprawie 18 marca 2026 r. Naczelny Sąd Administracyjny oddalił skargę kasacyjną organu i utrzymał w mocy korzystny wyrok WSA wydany w sprawie naszego klienta dotyczącej zakresu zwolnienia podatkowego w Polskiej Strefie Inwestycji.
Choć rozstrzygnięcie zapadło w konkretnej sprawie, jego znaczenie wykracza poza interes jednego podatnika. Dotyczy bowiem zagadnienia, które od dłuższego czasu budzi istotne wątpliwości w praktyce stosowania przepisów o PSI: czy decyzje o wsparciu wydane przed 1 stycznia 2022 r. mogą być po nowelizacji ustawy o CIT rozliczane według bardziej zawężającego podejścia, ograniczającego zwolnienie wyłącznie do dochodu z nowej inwestycji.
Istota sporu
Sedno sprawy sprowadzało się do sposobu odczytania relacji pomiędzy treścią decyzji o wsparciu a późniejszą zmianą przepisów. Organ przyjmował bowiem, że decyzja wydana w poprzednim stanie prawnym powinna być w praktyce rozliczana z uwzględnieniem logiki przepisu obowiązującego już po nowelizacji.
To właśnie w tym miejscu ujawnia się zasadnicza słabość takiej argumentacji. Trudno bowiem uznać za przekonujące stanowisko, w którym skutki decyzji wydanej w określonym otoczeniu prawnym są oceniane przez pryzmat późniejszych, mniej korzystnych regulacji, mimo że sama decyzja nie uległa zmianie. W ujęciu praktycznym prowadziłoby to do ograniczania zakresu wcześniej przyznanego wsparcia bez ingerencji w treść samego aktu, z którego to wsparcie wynika.
Dlaczego ten problem ma znaczenie szersze niż jedna sprawa
Nie jest to spór o charakterze wyłącznie doktrynalnym. Dla przedsiębiorców korzystających z PSI chodzi o rzeczywisty zakres dostępnej pomocy publicznej, sposób ustalania dochodu zwolnionego oraz bezpieczeństwo przyjętego modelu rozliczeń podatkowych.
W wielu przypadkach przyjęcie zawężającego podejścia może prowadzić do istotnego zmniejszenia skali zwolnienia. Oznacza to nie tylko wymierny efekt finansowy, ale również zwiększone ryzyko sporów w kolejnych latach podatkowych. Z tej perspektywy sprawa naszego klienta dotyka problemu o istotnym znaczeniu systemowym: granic dopuszczalnej reinterpretacji skutków decyzji o wsparciu wydanych przed zmianą przepisów.
Znaczenie rozstrzygnięcia NSA
Na obecnym etapie najważniejszy jest sam rezultat postępowania kasacyjnego. NSA oddalił skargę organu, a tym samym korzystny dla naszego klienta wyrok WSA został utrzymany w mocy.
To rozstrzygnięcie ma znaczenie praktyczne co najmniej z dwóch powodów. Po pierwsze, stanowisko organu nie doprowadziło do podważenia korzystnej dla podatnika oceny przyjętej przez sąd pierwszej instancji. Po drugie, wynik tej sprawy stanowi istotny punkt odniesienia dla przedsiębiorców, którzy pozostają w sporach opartych na zbliżonej konstrukcji argumentacyjnej organów.
Oczywiście pełny zakres znaczenia tego wyroku będzie można ocenić po publikacji pisemnego uzasadnienia. Już dziś jednak widać, że próba automatycznego przenoszenia późniejszej, bardziej restrykcyjnej logiki przepisu na decyzje o wsparciu wydane przed 2022 r. nie zyskała w tej sprawie akceptacji prowadzącej do uchylenia korzystnego wyroku WSA.
Co to oznacza dla firm posiadających decyzje o wsparciu sprzed 2022 r.
Dla przedsiębiorców mających decyzje o wsparciu wydane przed 1 stycznia 2022 r. rozstrzygnięcie to powinno być sygnałem do ponownego przyjrzenia się przyjętym modelom rozliczeń. Dotyczy to w szczególności tych sytuacji, w których zakres zwolnienia został ujęty bardzo ostrożnie wyłącznie z uwagi na restrykcyjne stanowisko prezentowane przez organy.
W praktyce warto zweryfikować, czy sposób ustalania dochodu zwolnionego rzeczywiście wynika z treści decyzji o wsparciu i realiów prowadzonej działalności, czy też został przyjęty przede wszystkim z ostrożności procesowej. W części przypadków taka weryfikacja może prowadzić do wniosku, że dotychczasowy model rozliczeń został zbudowany w sposób bardziej zawężający, niż byłoby to konieczne.
Kiedy taki przegląd jest szczególnie uzasadniony
Analiza przyjętych rozliczeń jest zasadna nie tylko wówczas, gdy spór z organem już trwa. Często większe znaczenie ma ona na wcześniejszym etapie – przy porządkowaniu dokumentacji, ocenie ekspozycji podatkowej oraz przygotowaniu argumentacji na wypadek kontroli.
W przypadku firm działających w PSI taki przegląd powinien obejmować przede wszystkim treść decyzji o wsparciu, zakres działalności objętej zwolnieniem, przyjętą metodologię ustalania dochodu zwolnionego oraz jakość dokumentacji, która miałaby uzasadniać dane podejście w ewentualnym postępowaniu.
Podsumowanie
Oddalenie skargi kasacyjnej organu w sprawie naszego klienta jest istotnym rozstrzygnięciem dla praktyki stosowania zwolnienia podatkowego w PSI. Znaczenie tej sprawy nie sprowadza się wyłącznie do korzystnego wyniku procesowego. Dotyczy ona bowiem fundamentalnego pytania o to, czy skutki decyzji o wsparciu wydanych przed 2022 r. mogą być ograniczane przez odwołanie do późniejszych, mniej korzystnych zmian legislacyjnych.
Dla przedsiębiorców jest to wyraźny sygnał, że przyjęte modele rozliczeń warto oceniać przez pryzmat treści decyzji o wsparciu oraz zasad obowiązujących w dacie jej wydania, a nie wyłącznie przez pryzmat najbardziej restrykcyjnej interpretacji prezentowanej przez organ. Pisemne uzasadnienie wyroku pozwoli lepiej ocenić zakres jego oddziaływania na inne sprawy, już dziś jednak rozstrzygnięcie to stanowi ważny punkt odniesienia dla firm posiadających decyzje o wsparciu sprzed 2022 r.
Piotr Szymański
Doradca podatkowy















































